Celem nadrzędnym Programu jest wzrost jakości partnerstw transgranicznych zawiązywanych przez podmioty działające w Polsce i innych krajach objętych programem na poziomie lokalnym i regionalnym. Poprzez jakość partnerstw rozumie się ich trwałość, rzetelność i funkcjonowanie na zasadzie równości stron. 
Celem realizowanych projektów może być więc zarówno wypracowanie nowych lub wzbogacenie istniejących partnerstw transgranicznych. Ponadto projekty powinny być wzbogacone o wykorzystanie istniejących tzw. „dobrych praktyk” (wiedza, doświadczenia, umiejętności) z krajów UE/EOG na rzecz organizacji polskich. 
Bezpośrednim beneficjentem działań projektu powinny być podmioty polskie. W przypadku projektów wielostronnych, zawierających elementy współpracy z partnerami spoza UE/EOG, część działań może być skierowana do beneficjentów z innych krajów niż Polska, jednak nie mogą one dominować w projekcie. 

Uwzględniając powyższe, Wnioskodawcy ubiegać się mogą o dofinansowanie projektów realizowanych w następujących obszarach: 

1. tworzenie i wdrażanie programów współpracy transgranicznej mających na celu poprawę funkcjonowania administracji samorządowej oraz pobudzanie inicjatyw społecznych, inicjatyw służących ochronie zdrowia oraz rozwojowi przedsiębiorczości w regionach,
2. transfer wiedzy z regionów lepiej do słabiej rozwiniętych,
3. promocja rozwoju regionalnego i lokalnego w Polsce,
4. zapewnienie rozwoju systemu komunikowania się i wymiany informacji,
5. współpraca w zakresie transgranicznej turystyki ekologicznej,
6. szkolenia dla pracowników administracji rządowej i samorządowej mające na celu podwyższenie kwalifikacji zawodowych.